La mosquée de Bolbaite, bénie comme église en 1521 à la suite de la guerre germanique, devient dépendante de Chella en 1525, d’où la paroisse est séparée en 1535, sous le patronage de San Francisco de Paula, qui avait été canonisé quelques années auparavant, en 1519. En 1574, après avoir visité le lieu, l’archevêque de Valencia et patriarche San Juan de Ribera attire l’attention du seigneur de la baronnie, Jeroni II de Cabanyelles alias Vila-rasa, sur le mauvais état de l’église. Ce dernier a dû la reconstruire et l’orner, en plus de fournir au prêtre une maison abbatiale (années 1580-1590). En échange, l’Église lui accorde, ainsi qu’aux seigneurs successifs de Bolbaite, le droit de patronage, c’est-à-dire le droit de nommer les curés.
L’ancienne église morisque était suffisante à partir de 1612 pour accueillir la nouvelle paroisse des Vieux Chrétiens, mais elle a dû être reconstruite en raison de la grande croissance que Bolbaite a connue au XVIIIe siècle. Les travaux ont commencé en 1780, et le résultat est une nef de style néoclassique, avec des chapelles latérales entre les contreforts, couverte d’une voûte en demi-berceau sur cinq travées. La sacristie et la chapelle de communion sont situées de part et d’autre du presbytère, avec une niche à l’avant. L’appareil est de type maçonnerie, avec la plinthe et les angles renforcés par des pierres de taille et un enduit stuqué en façade. La façade est surmontée d’un profil mixtiligne couronné de pinacles. Au centre de la façade se trouve un retable de la fin du baroque, d’une symétrie marquée et d’une décoration élégante : une porte encadrée par des pilastres à chapiteaux composites, une niche supérieure avec la sculpture du saint titulaire, et une grande fenêtre couverte de moulures arquées, le tout combiné à des pinacles gothiques, typiques du XVIIIe siècle. Derrière la façade, à demi caché derrière le rideau de la façade, le clocher s’élève sur le côté gauche.
À l’intérieur, la couleur blanche des murs met en valeur les pilastres ondulés avec chapiteau composite et doré qui articulent les chapelles latérales. Celles-ci étaient couvertes de voûtes et abritent, entre autres images de culte, celle du Christ de l’Amparo. La grande niche du presbytère, présidée par la sculpture solitaire de saint François (l’ancienne, détruite en 1936, était l’œuvre du sculpteur Nicolás de Bussi), est décorée de fresques du peintre Salvador Pallás, enfant de Chella, représentant des scènes de la vie de saint François de Paula. Elles ont été restaurées en 1976 par Enrique et Bartolomé Casoval. Le « Saint » par excellence, comme on l’appelle populairement, est très vénéré à Bolbaite et une précieuse relique de lui est conservée dans la sacristie. Le clocher est une tour prismatique, aux moulures simples, construite au XIXe siècle, couronnée de boules et d’une lanterne octogonale soutenue par des contreforts. Elle abrite la plus grande cloche, dédiée à San Francisco de Paula et Santa Bárbara, de 1851 ; la cloche de taille moyenne, dédiée au Christ del Amparo, œuvre des frères Portilla, de 1996, et une autre cloche plus petite, œuvre du fondeur Manuel Roses, de 1942, appelée « el Joaquín ».
