L’église primitive a été construite au milieu du XVIe siècle. Elle a été agrandie à différentes époques, les principales interventions ayant eu lieu au XVIIIe siècle, avec sa voûte en berceau et la construction du maître-autel en 1702, présidé par une toile de l’Immaculée Conception, patronne de la localité, que l’on peut encore voir aujourd’hui dans l’église. Derrière l’image qui se soulève pour révéler l’alcôve centrale, il y avait un Christ auquel on vouait une grande dévotion et qui sera transféré à l’Ermitage au milieu du XVIIIe siècle, après sa construction, sous le patronage du Christ de la Proviedencia.
Le tremblement de terre de 1748 a provoqué l’effondrement d’une partie de ses voûtes et des dommages à certaines de ses chapelles latérales et à son clocher. La reconstruction fut rapide grâce au soutien du roi Ferdinand VI, de l’archevêché et du comte de Puñonrostro. Le produit de cette restauration a été les peintures à la détrempe avec de fins dessins baroques que nous pouvons voir aujourd’hui dans la voûte de la nef centrale, après leur découverte en 2004.
Pendant l’année qu’a duré la reconstruction, des messes ont été célébrées dans la cour et la chapelle du palais, ainsi que sur la façade du palais, sur la Plaza de la Alameda. En janvier 1749, l’église officiait déjà régulièrement et le Christ qui se trouvait à l’origine dans l’alcôve du maître-autel de la paroisse fut déplacé à l’Ermitage, prenant sa place avec une image sculpturale de l’Immaculée Conception, déplaçant la toile de l’Immaculée Conception sur l’un des murs du sanctuaire.
Le résultat des différentes interventions a donné naissance à une église rectangulaire couverte d’une voûte en berceau, avec un chœur droit et 6 chapelles latérales entre contreforts sur le côté droit, l’une d’elles étant dédiée au saint patron de la ville, San Antonio Abad. À gauche de la nef centrale se trouvent la chapelle de la Virgen de los Desamparados (Notre-Dame des Abandonnés) et une grande chapelle de communion voûtée avec lunettes, commencée en 1770, prenant du terrain du la la maison abbatiale, dont l’aspect actuel est le résultat de travaux effectués en 1929, tandis que la châsse du Cœur de Jésus date de 1934.
Le clocher actuel a été construit à l’extrémité opposée du premier, mais toujours à côté de l’abreuvoir-lavoir de La Canaleta. L’escalier d’origine, à droite de l’autel principal, témoigne encore du précédent. Lorsqu’il a été endommagé par le tremblement de terre et que sa reconstruction s’est avérée infructueuse sur le plan structurel et esthétique, il a été décidé de le démolir, de sorte qu’entre 1910 et 1912, celui que nous contemplons actuellement a été érigé avec un plan carré et 34 mètres de haut avec un corps de 4 cloches, la plus ancienne étant dédiée à San Antonio Abad, datant de 1781.
Au début de la guerre civile, la plupart des images ont été brûlées et le temple a été transformé en marché. Après la guerre, des années de reconstruction des autels et d’acquisition de nouvelles sculptures ont suivi, retournant à l’église paroissiale de l’Immaculée Conception, d’autres sauvées par le voisinage, comme celle de San Francisco ou la toile de l’Immaculée Conception.
Ces dernières années, la chapelle de communion et les chapelles latérales ont été embellies, retrouvant la splendeur qu’elles avaient dans la seconde moitié du XVIIIe siècle.